Erbaut wurde die Heilig Geist Spitalkirche 1399 – 1402. Zusammen mit der Kirche wurde auch der Gebäudetrakt nebenan errichtet, der ursprünglich ein Spital und Hospiz war, das der Pflege von Alten, Kranken und von Pilgern auf ihrem Weg nach Italien diente. Das Spital und die Pilger waren für Sterzing von großer Bedeutung, das erkennt man auch am Sterzinger Stadtwappen. Dieses zeigt unter dem roten Adler einen Pilger mit Krückstock und Rosenkranz.
Der Bau des Heilig Geist Spitals und der Spitalkirche fiel in die Zeit des Aufschwungs in Sterzing. Im 14. Jahrhundert hatte der Bergbau im großen Stil im Wipptal und den angrenzenden Seitentälern eingesetzt, der Sterzing zur Blüte verhalf. Viele Handelsfamilien siedelten sich in Sterzing an, u.a. auch die legendären Fugger aus Augsburg. Damit kam es zu reger Bautätigkeit in der Stadt, das Rathaus, der Zwölferturm und die Pfarrkirche entstanden ebenso wie viele Patrizierhäuser und prägen noch heute das Stadtbild.
Die Spitalkirche überrascht den Besucher in ihrem Inneren mit einem hohen Raum voll unvermuteter Farbenpracht. Die Wände und Gewölbe sind aufs kunstvollste mit herrlichen Fresken geschmückt, die der Südtiroler Maler Hans von Bruneck zwischen 1400 und 1415 erschaffen hat. Hans von Bruneck war einer der Begründer und Hauptvertreter der berühmten Pustertaler Malerschule des 15. Jahrhunderts, der z.B. auch Michael Pacher angehörte. Die Fresken in der Spitalkirche stellen die wichtigsten Aussagen des christlichen Glaubensbekenntnisses dar, wobei die einzelnen Szenen zu einem großen Gemälde verschmelzen. Im Zuge späterer Umgestaltungen des Kirchenraumes waren diese wertvollen Fresken übermalt worden und wurden erst 1939 bei Renovierungsarbeiten wieder freigelegt. Bei einer weiteren Renovierung in den 1980er-Jahren wurden die Fresken dann fachmännisch restauriert und von allen Übermalungen gereinigt. So kann man heute diesen bedeutenden Freskenzyklus wieder in seiner ganzen ursprünglichen Pracht und Symbolkraft bewundern.
Die Sterzinger Heilig Geist Spitalkirche ist das ganze Jahr täglich von 8:30 bis 12 und von 14:30 bis 18 Uhr geöffnet, nur am Samstagnachmittag und Sonntag ist sie geschlossen.